Det er 200 år siden, at Ripley (Sigourney Weaver) bragte det ultimative offer. Nu har videnskabsmænd klonet hende og rumdronningen indeni hende i håb om at skabe det ultimative våben.
200 år efter hendes sidste eventyr bliver Ripley klonet af militære videnskabsmænd, som udtrækker en rumdronning fra hendes bryst og udnytter det faktum, at både Ripley og rumvæsenet er genetiske hybrider. I mellemtiden slår Ripley sig sammen med en flok smuglere, deriblandt en avanceret kvindelig androide, for at bekæmpe de hærgende rumvæsener i et laboratorieskib, der suser mod jorden.