Fox Mulder und Dana Scully kehren zurück für eine Fortsetzung des Originals: Akte X - Der Film und des TV-Serienhits.
Als eine Gruppe Frauen auf mysteriöse Art entführt wird, wird die Spurensuche zu einem typischen Fall für Akte X. Das beste Team für diese Aufgabe sind Ex-Agenten Fox Mulder und Dr. Dana Scully, die keinerlei Interesse daran haben, sich wieder in ihre dunkle Vergangenheit zu begeben. Doch die Wahrheit über diese schrecklichen Verbrechen ist irgendwo da draußen… und es wird an Mulder und Scully liegen, sie zu finden.