Suite à l'écrasement de son vaisseau sur une planète inexplorée, un jeune pilote venu de la Terre intègre une armée rebelle composée de singes, d'humains et de singes humanoïdes proscrits dans un combat pour la liberté qui le conduira à découvrir que sa venue en tant que deuxième fondateur de ce monde avait été prédite.
Dans cette épopée chargée d'action réalisée par Tim Burton, Leo, un astronaute impétueux (Mark Wahlberg) s'écrase sur une planète inconnue où des primates parlants dominent les humains. Afin de retourner chez lui, Leo devra échapper à une armée de gorilles invincibles dirigée par un impitoyable général (Tim Roth) et atteindre un temple sacré renfermant des secrets bouleversants sur le passé de l'humanité ainsi que son seul espoir de survie.