Le propriétaire de Toontown est assassiné et tous accusent la star du dessin animé, Roger Rabbit. Le juge Doom, affamé de pouvoir, est à ses trousses et Roger supplie le détective Valiant de trouver le malfaiteur. Mais l'intrigue se corse lorsqu'Eddie découvre scandale après scandale. L'existence de Toontown est en jeu!
Hollywood, 1947. Le détective Valiant doit prouver que Marvin Acme, propriétaire de Toontown, batifole avec Jessica Rabbit, épouse de Roger Rabbit. Quand Acme est assassiné, tous accusent Roger, et le juge Doom assoiffé de pouvoir veut poursuivre Roger en justice. L'intrigue se corse lorsqu'Eddie découvre scandale après scandale. Roger supplie Valiant de trouver le malfaiteur alors que l'existence même de Toonville est en jeu. Qui veut la peau de Roger Rabbit, avec son mélange avant-gardiste de scènes d'action réelle et de personnages animés, procure un plaisir délirant.
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