Ripley, qui fut la seule survivante du Nostromo, est retrouvée en hypersommeil 50 ans après son affrontement avec l'infernale créature. Elle apprend coup sur coup que non seulement la planète abritant les créatures a été colonisée, mais que le contact a été perdu avec cette colonie. Ripley est alors renvoyée sur la planète maudite avec une troupe de Marines de l'espace...
Cinquante-sept ans après "Alien", Ripley se réveille de sa biostase et tente de mettre en garde ses chefs contre des créatures spatiales monstrueuses sillonnant l'espace en détruisant toute vie humaine. La compagnie fait la sourde oreille, jusqu'à ce que le contact avec les colons de la planète LV-426 s’interrompe brusquement. Ripley doit y retourner avec l'armée pour éradiquer ces créatures.