雇い主に見放され、不本意ながら胡散臭い政治的暗殺に巻き込まれたヒットマンは、ロシア人娼婦に心を引かれてしまい、そのせいで任務も完了しないうちに面倒を抱えることになる。
人気テレビゲームシリーズを原作とした本作品は、遺伝子操作を受けた一流の殺し屋エージェント47の物語だ。存在そのものが罪にも見えるこの男は、この世から悪を排除するために戦う。頭脳明晰でカリスマ性があり、謎に包まれた彼は、頭に彫られたバーコードの下2桁のみで呼ばれる。完全無欠な47にも想定できなかったのは、謎めいたロシア人女性に抱いたはじめての感情だった。