ハリソン・フォード演じるインディアナ・ジョーンズが、聖杯を探索中に消えた父親を捜す旅に出る。残されたわずかな時間の中で、ジョーンズ親子は聖杯を探す冒険を繰り広げる。悪の勢力の手に渡る前に彼らは聖杯を見つけなければならない。
大人気シリーズの3作目である本作ではインディアナ・ジョーンズが、聖杯を探索中に悪の勢力によって拉致された父親を捜す旅に出る。痕跡を追ってアメリカからベニス、そして中東の砂漠へ向かったインディは、父親を救出し、聖杯を守ろうとする。アクション満載の冒険物語。