Officier van jusititie Jim Garrison uit New Orleans neemt de taak op zich om de moordaanslag op president John F. Kennedy in Dallas, Texas, in 1963 te onderzoeken. Door wat hij ontdekt, gaat hij vermoeden dat er meer achter het verhaal zit dan het publiek verteld wordt.
JFK toont de acties van officier van justitie Jim Garrison uit New Orleans, die de taak op zich neemt om de moordaanslag op president John F. Kennedy in Dallas, Texas, in 1963 te onderzoeken. Garrison wantrouwt het officiële verhaal van de FBI door wat hij al weet en door wat hij vervolgens ontdekt, gaat hij vermoeden dat er meer achter het verhaal zit dan het publiek wordt verteld.