Legion, gebaseerd op het Marvel Comics-personage, volgt het verhaal van David Haller, een gekwelde jongeman die misschien wel bovenmenselijk is.
Legion gaat over David Haller, een gekwelde jongeman bij wie als kind schizofrenie is vastgesteld. Na een reeks opnamen in psychiatrische klinieken, wordt David op zijn 30e verliefd op een mooie, tevens gekwelde medepatiënt genaamd Syd. Na een onthutsende aanvaring moet hij de schokkende mogelijkheid onder ogen zien dat zijn visioenen en de stemmen die hij hoort, misschien wel echt zijn. Met de hulp van Syd en een team van specialisten die ook unieke en buitengewone gaven bezitten, onthult David een diep weggestopte waarheid: hij werd zijn hele leven geplaagd door een kwaadaardige parasiet van onvoorstelbare kracht.