Ved å reise tolv år tilbake i tid til da han gikk på ungdomsskolen (de beste årene i sitt liv), omskriver Takemichi historien ved å ta forskjellige valg for å redde kjæresten sin i fremtiden.
Takemichi Hanagaki har allerede uflaks og er knust over å få vite at hans livs kjærlighet fra ungdomsskoleårene er blitt drept av den kriminelle Tokyo Manji-gjengen.
Mens Takemichi venter på et tog dagen etter, blir han dyttet bakfra overbord til et møtende tog. Forberedt på å dø våkner han i stedet og finner ut at han har reist tolv år tilbake i tid og er igjen ungdomsskoleelev. Nå kan Takemichi omskrive historien ved å ta forskjellige valg i håp om å forhindre kjærestens død.
Enkelte sekvenser eller mønster med blinkede lys kan påvirke lysfølsomme seere.