Legion, basert på Marvel-tegneserien, følger David Hallers historie, en mann som trodde han var schizofren, men som oppdager at han kanskje er den mektigste mutanten i verden.
Legion følger David Hallers historie, en engstelig ung mann som ble diagnostisert med schizofreni som barn. Han ble sendt fra den ene psykiatriske institusjonen til den andre, og da han er i begynnelsen av 30-årene møter han, og blir forelsket i, en vakker og engstelig medpasient ved navn Syd. Etter et forbløffende møte med henne, blir han tvunget til å konfrontere den sjokkerende muligheten for at stemmene han hører, og synene han ser, faktisk kan være ekte. Med hjelp fra Syd og et team av spesialister, som også har unike og ekstraordinære egenskaper, finner David en dypt undertrykt sannhet: han har blitt plaget hele livet av en ondsinnet, mektig parasitt.