Minęło 200 lat, odkąd Ripley (Sigourney Weaver) poniosła największą ofiarę. Teraz naukowcy sklonowali ją – wraz z królową obcych w jej wnętrzu – w nadziei na wyhodowanie broni ostatecznej.
200 lat po swojej ostatniej przygodzie Ripley zostaje sklonowana przez naukowców wojskowych, którzy wydobywają królową obcych z jej ciała i wykorzystują fakt, że zarówno Ripley, jak i obcy są genetycznymi hybrydami. Tymczasem Ripley łączy siły z grupą przemytników, w tym z zaawansowanym żeńskim androidem, by stawić czoła rozszalałym obcym na pokładzie statku-laboratorium, który pędzi w kierunku Ziemi...