砂漠の惑星タトゥイーンに、二人の少年フィニアスとファーブが住んでいた。ある晩、スピーダーで走っているとR2ーD2にぶつかり、「デス・スター設計図」を入手してしまう。銀河の運命は彼らの肩にかかっていて、彼らは反乱軍にそれを返すために出発する。
砂漠の惑星タトゥイーンに、二人の少年フィニアスとファーブが住んでいた。ある晩、スピーダーで走っているとR2ーD2にぶつかり、「デス・スター設計図」を入手してしまう。銀河の運命は彼らの肩にかかっていて、ハンソロのライバルの操縦士、イザベラを雇って反乱軍の惑星へ返しに行こうとする。帝国軍には、悪を懲らしめたいという思いに燃えるストームトルーパーのキャンディスは反乱軍をやっつけることを熱望していて、デス・スターの計画を復活させる希望を持って反乱軍を銀河中追いかける。一方、ダースェンシュマーツが彼の新しい”ネーター”を使用するのをエージェントPが阻止しようとしている間、ペリー・ザ・レベルパスがカーボナイトに閉じ込められたとき、銀河系間の混乱がデス・スターに発生。ファーブが偶然にも「シス ・ネーター」のビームを浴び、暗黒面へ落ちていて、兄弟同士の初めての壮大な戦いへと導いたとき、話はさらに悪い方へと舵をきる。